La RRASCA se fundó en el año de 1992, luego de que una Misión de Identificación integrada por el Programa de Agua y Saneamiento del Banco Mundial (WSP), la Agencia Suiza para el Desarrollo y la Cooperación (COSUDE), la Agencia para el Desarrollo Internacional de los Estados Unidos (USAID), la Organización Panamericana de la Salud de la Organización Mundial de la Salud (OPS/OMS), el Fondo de las Naciones Unidas para la Infancia (UNICEF) y el Programa de Desarrollo de las Naciones Unidas (PNUD), encontrara en Honduras, Nicaragua y el Salvador una gran confusión institucional, una limitada capacidad del sector y finalmente políticas y estrategias ineficaces.

La Misión recomendó aplicar en Centroamérica un mecanismo basado en la colaboración y concluyó que era necesario combinar los esfuerzos de los gobiernos, organismos no gubernamentales, comunidades y agencias internacionales. La colaboración regional fue entendida como el medio para promover y sostener intercambios en los actores del sector y los países, así como para difundir las innovaciones y las buenas practicas en la región.